Homebrew + Python auf mac os x 10.8: Fatal Python error: PyThreadState_Get: kein aktueller Thread importiert mapnik

Ich habe 2 Pythons auf meinem Mac (10.8.3): Die Voreinstellung und 2.7 Version von homebrew.

Bisher konnte ich Module installieren und sie mit meiner brauen python benutzen. Ich habe mapnik mit brew install mapnik (mapnik-2.1.0) brew install mapnik und korrekt kompiliert. Aber wenn ich Python öffnen und import mapnik , der folgende Fehler kommt und Python beendet:

 >>> import mapnik Fatal Python error: PyThreadState_Get: no current thread Abort trap: 6 

Mac os x zeigt auch ein Fehlerfenster mit folgendem Inhalt:

 Process: Python [60666] Path: /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Resources/Python.app/Contents/MacOS/Python Identifier: Python Version: 2.7.3 (2.7.3) Code Type: X86-64 (Native) Parent Process: bash [60454] User ID: 501 Date/Time: 2013-03-28 10:21:08.535 +0100 OS Version: Mac OS X 10.8.3 (12D78) Report Version: 10 Interval Since Last Report: 128837 sec Crashes Since Last Report: 5 Per-App Crashes Since Last Report: 4 Anonymous UUID: 567121E6-7BAC-335F-E3B0-DD24D1F9E6BA Crashed Thread: 0 Dispatch queue: com.apple.main-thread Exception Type: EXC_CRASH (SIGABRT) Exception Codes: 0x0000000000000000, 0x0000000000000000 Application Specific Information: abort() called Thread 0 Crashed:: Dispatch queue: com.apple.main-thread 0 libsystem_kernel.dylib 0x00007fff94500d46 __kill + 10 1 libsystem_c.dylib 0x00007fff92afddf0 abort + 177 2 org.python.python 0x0000000105a77eaa Py_FatalError + 49 3 org.python.python 0x0000000105a76370 PyThreadState_Get + 28 4 org.python.python 0x0000000105a71f16 Py_InitModule4_64 + 58 5 libboost_python-mt.dylib 0x0000000104153288 boost::python::detail::init_module(char const*, void (*)()) + 40 6 org.python.python 0x00000001029fa716 _PyImport_LoadDynamicModule + 150 7 org.python.python 0x00000001029fa428 import_submodule + 296 8 org.python.python 0x00000001029f9ff1 load_next + 268 9 org.python.python 0x00000001029f80fb PyImport_ImportModuleLevel + 794 10 org.python.python 0x00000001029de9d3 builtin___import__ + 132 11 org.python.python 0x000000010296e335 PyObject_Call + 101 12 org.python.python 0x00000001029e8e10 PyEval_CallObjectWithKeywords + 93 13 org.python.python 0x00000001029e61b6 PyEval_EvalFrameEx + 11727 14 org.python.python 0x00000001029e32bd PyEval_EvalCodeEx + 1638 15 org.python.python 0x00000001029e2c51 PyEval_EvalCode + 54 16 org.python.python 0x00000001029f6e58 PyImport_ExecCodeModuleEx + 247 17 org.python.python 0x00000001029f99bf load_source_module + 1053 18 org.python.python 0x00000001029f9c7e load_package + 334 19 org.python.python 0x00000001029fa428 import_submodule + 296 20 org.python.python 0x00000001029f9ff1 load_next + 268 21 org.python.python 0x00000001029f80fb PyImport_ImportModuleLevel + 794 22 org.python.python 0x00000001029de9d3 builtin___import__ + 132 23 org.python.python 0x000000010296e335 PyObject_Call + 101 24 org.python.python 0x00000001029e8e10 PyEval_CallObjectWithKeywords + 93 25 org.python.python 0x00000001029e61b6 PyEval_EvalFrameEx + 11727 26 org.python.python 0x00000001029e32bd PyEval_EvalCodeEx + 1638 27 org.python.python 0x00000001029e2c51 PyEval_EvalCode + 54 28 org.python.python 0x0000000102a01a2b run_mod + 53 29 org.python.python 0x0000000102a0184d PyRun_InteractiveOneFlags + 365 30 org.python.python 0x0000000102a01367 PyRun_InteractiveLoopFlags + 188 31 org.python.python 0x0000000102a01218 PyRun_AnyFileExFlags + 60 32 org.python.python 0x0000000102a120b2 Py_Main + 3210 33 libdyld.dylib 0x00007fff966bf7e1 start + 1 Thread 0 crashed with X86 Thread State (64-bit): rax: 0x0000000000000000 rbx: 0x00007fff5d29c2b0 rcx: 0x00007fff5d29c298 rdx: 0x0000000000000000 rdi: 0x000000000000ecfa rsi: 0x0000000000000006 rbp: 0x00007fff5d29c2c0 rsp: 0x00007fff5d29c298 r8: 0x00000000000003f5 r9: 0x00007fff5d29c270 r10: 0x00007fff94502342 r11: 0x0000000000000206 r12: 0x00007fff5d29cb00 r13: 0x0000000102e9b656 r14: 0x00000000000003f5 r15: 0x0000000000000000 rip: 0x00007fff94500d46 rfl: 0x0000000000000206 cr2: 0x00007fff7bff7ff0 Logical CPU: 0 Binary Images: 0x102961000 - 0x102961fff +org.python.python (2.7.3 - 2.7.3) <62DA7BCA-2A0C-3753-A043-7459827F56D1> /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Resources/Python.app/Contents/MacOS/Python 0x102964000 - 0x102a6cfff +org.python.python (2.7.3, [c] 2004-2012 Python Software Foundation. - 2.7.3) <81E6FB4A-287C-37C3-A26D-D045B604933F> /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python 0x102c4c000 - 0x102c4efff +readline.so (0) <C4F1219C-CDFD-37D2-A762-22974D3F2918> /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-dynload/readline.so 0x102c54000 - 0x102c77fff +libreadline.6.2.dylib (6.2) <2131C2A4-E75D-3680-9C8D-E42D78A5E1B9> /usr/local/opt/readline/lib/libreadline.6.2.dylib 0x102cfc000 - 0x102d01fff +itertools.so (0) <F857A819-40A9-3F72-A0B1-3E97BA5F3DAA> /usr/local/Cellar/python/2.7.3/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/lib-dynload/itertools.so 0x102d0a000 - 0x102f2cfff +_mapnik.so (0) <433DAD47-AB4D-37C5-A0EA-FE1134B63D3D> /usr/local/lib/python2.7/site-packages/mapnik/_mapnik.so 0x103603000 - 0x103978ff7 +libmapnik.dylib (0) <0E898678-9D86-35B4-A772-0248924F5BF3> /usr/local/Cellar/mapnik/2.1.0/lib/libmapnik.dylib 0x104138000 - 0x104170ff7 +libboost_python-mt.dylib (0) <9B5DD680-BEC9-3988-9F55-F59DA38CC175> /usr/local/lib/libboost_python-mt.dylib 0x1041b3000 - 0x1041c2ff7 +libboost_thread-mt.dylib (0) <24432300-9373-30B6-89F6-857CBEF9C105> /usr/local/lib/libboost_thread-mt.dylib 0x1041de000 - 0x10424dff7 +libfreetype.6.dylib (0) <490EDE42-5B78-34BA-85E7-D0547BE778E1> /usr/local/lib/libfreetype.6.dylib 0x104262000 - 0x104268fff +libltdl.7.dylib (0) <E437E59F-FC2E-3837-BDF8-301BEF13C7D6> /usr/local/lib/libltdl.7.dylib 0x10426c000 - 0x10428bff7 +libpng15.15.dylib (0) <52907DBF-A04C-325D-9E77-DF56A771026F> /usr/local/lib/libpng15.15.dylib 0x104293000 - 0x1042e6fff +libtiff.5.dylib (0) <AE85D7B1-F4E5-3B27-832D-5756EFCDE912> /usr/local/lib/libtiff.5.dylib 0x1042f2000 - 0x104326fff +libproj.0.dylib (0) <C799D9A7-0DDA-334D-9AEA-13A4AE7A67A2> /usr/local/lib/libproj.0.dylib 0x104333000 - 0x104441ff7 +libicuuc.50.1.dylib (0) <5FDBBF25-EEA6-3649-9ED6-B18CE89CE510> /usr/local/opt/icu4c/lib/libicuuc.50.1.dylib 0x1044a3000 - 0x1044b2fff +libboost_filesystem-mt.dylib (0) <B2C03485-5FA6-3744-BC99-DB4E87DA4D87> /usr/local/lib/libboost_filesystem-mt.dylib 0x1044c3000 - 0x1044c5ff7 +libboost_system-mt.dylib (0) <FE5E6E11-C7FB-3895-9976-526D22997EDC> /usr/local/lib/libboost_system-mt.dylib 0x1044ca000 - 0x104578fff +libboost_regex-mt.dylib (0) <BC1D7F46-F6AB-3964-B344-E692EFC5D3B7> /usr/local/lib/libboost_regex-mt.dylib 0x10461c000 - 0x10464bff7 +libjpeg.8.dylib (0) <9EC07360-CF18-3529-AE54-E60DBF1313DC> /usr/local/lib/libjpeg.8.dylib 0x104652000 - 0x105a24fff +libicudata.50.dylib (0) <B74D5789-7082-3084-9BF0-9A3AE6F2B046> /usr/local/opt/icu4c/lib/libicudata.50.dylib 0x105a26000 - 0x105b33fff org.python.python (2.7.2 - 2.7.2) <E7F3EED1-E55D-32AF-9649-77C814693F6A> /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python 0x7fff62561000 - 0x7fff6259593f dyld (210.2.3) <36CAA36E-72BC-3E48-96D9-B96A2DF77730> /usr/lib/dyld 0x7fff8ae57000 - 0x7fff8ae7cff7 libc++abi.dylib (26) <D86169F3-9F31-377A-9AF3-DB17142052E4> /usr/lib/libc++abi.dylib 0x7fff8c50f000 - 0x7fff8c510ff7 libsystem_sandbox.dylib (220.2) <6838A6FD-8626-3356-BB4F-BB4787216207> /usr/lib/system/libsystem_sandbox.dylib 0x7fff8c511000 - 0x7fff8c523ff7 libz.1.dylib (43) <2A1551E8-A272-3DE5-B692-955974FE1416> /usr/lib/libz.1.dylib 0x7fff8d337000 - 0x7fff8d342fff libsystem_notify.dylib (98.5) <C49275CC-835A-3207-AFBA-8C01374927B6> /usr/lib/system/libsystem_notify.dylib 0x7fff8d9e6000 - 0x7fff8d9ebfff libcompiler_rt.dylib (30) <08F8731D-5961-39F1-AD00-4590321D24A9> /usr/lib/system/libcompiler_rt.dylib 0x7fff8dd72000 - 0x7fff8dd73fff libDiagnosticMessagesClient.dylib (8) <8548E0DC-0D2F-30B6-B045-FE8A038E76D8> /usr/lib/libDiagnosticMessagesClient.dylib 0x7fff902d7000 - 0x7fff90326ff7 libcorecrypto.dylib (106.2) <CE0C29A3-C420-339B-ADAA-52F4683233CC> /usr/lib/system/libcorecrypto.dylib 0x7fff9064f000 - 0x7fff90650fff libsystem_blocks.dylib (59) <D92DCBC3-541C-37BD-AADE-ACC75A0C59C8> /usr/lib/system/libsystem_blocks.dylib 0x7fff90a75000 - 0x7fff90a7dff7 libsystem_dnssd.dylib (379.37) <616FC901-151E-38BF-B2C4-24A351C5FAAD> /usr/lib/system/libsystem_dnssd.dylib 0x7fff914fd000 - 0x7fff9150afff libbz2.1.0.dylib (29) <CE9785E8-B535-3504-B392-82F0064D9AF2> /usr/lib/libbz2.1.0.dylib 0x7fff92899000 - 0x7fff928a7fff libcommonCrypto.dylib (60027) <BAAFE0C9-BB86-3CA7-88C0-E3CBA98DA06F> /usr/lib/system/libcommonCrypto.dylib 0x7fff92aa4000 - 0x7fff92b70ff7 libsystem_c.dylib (825.26) <4C9EB006-FE1F-3F8F-8074-DFD94CF2CE7B> /usr/lib/system/libsystem_c.dylib 0x7fff92bba000 - 0x7fff92bc0ff7 libunwind.dylib (35.1) <21703D36-2DAB-3D8B-8442-EAAB23C060D3> /usr/lib/system/libunwind.dylib 0x7fff92ed3000 - 0x7fff92f3cfff libstdc++.6.dylib (56) <EAA2B53E-EADE-39CF-A0EF-FB9D4940672A> /usr/lib/libstdc++.6.dylib 0x7fff93019000 - 0x7fff93065ff7 libauto.dylib (185.1) <73CDC482-16E3-3FC7-9BB4-FBA2DA44DBC2> /usr/lib/libauto.dylib 0x7fff930cf000 - 0x7fff930d5fff libmacho.dylib (829) <BF332AD9-E89F-387E-92A4-6E1AB74BD4D9> /usr/lib/system/libmacho.dylib 0x7fff93177000 - 0x7fff93199ff7 libxpc.dylib (140.42) <BBE558BD-5E55-35E4-89ED-1AA6B056D05A> /usr/lib/system/libxpc.dylib 0x7fff931f6000 - 0x7fff931f7ff7 libremovefile.dylib (23.2) <6763BC8E-18B8-3AD9-8FFA-B43713A7264F> /usr/lib/system/libremovefile.dylib 0x7fff931f8000 - 0x7fff93260ff7 libc++.1.dylib (65.1) <20E31B90-19B9-3C2A-A9EB-474E08F9FE05> /usr/lib/libc++.1.dylib 0x7fff9345d000 - 0x7fff9365dfff libicucore.A.dylib (491.11.2) <FD6282D8-DF3F-3842-8C2E-CF478D2B9669> /usr/lib/libicucore.A.dylib 0x7fff9365e000 - 0x7fff9365efff libkeymgr.dylib (25) <CC9E3394-BE16-397F-926B-E579B60EE429> /usr/lib/system/libkeymgr.dylib 0x7fff936d4000 - 0x7fff936dcfff liblaunch.dylib (442.26.2) <2F71CAF8-6524-329E-AC56-C506658B4C0C> /usr/lib/system/liblaunch.dylib 0x7fff9424d000 - 0x7fff9427bff7 libsystem_m.dylib (3022.6) <B434BE5C-25AB-3EBD-BAA7-5304B34E3441> /usr/lib/system/libsystem_m.dylib 0x7fff94284000 - 0x7fff94286fff libquarantine.dylib (52) <4BE2E642-A14F-340A-B482-5BD2AEFD9C24> /usr/lib/system/libquarantine.dylib 0x7fff94381000 - 0x7fff94382ff7 libdnsinfo.dylib (453.19) <14202FFB-C3CA-3FCC-94B0-14611BF8692D> /usr/lib/system/libdnsinfo.dylib 0x7fff944ef000 - 0x7fff9450aff7 libsystem_kernel.dylib (2050.22.13) <5A961E2A-CFB8-362B-BC43-122704AEB047> /usr/lib/system/libsystem_kernel.dylib 0x7fff94579000 - 0x7fff94587ff7 libsystem_network.dylib (77.10) <0D99F24E-56FE-380F-B81B-4A4C630EE587> /usr/lib/system/libsystem_network.dylib 0x7fff94821000 - 0x7fff9493992f libobjc.A.dylib (532.2) <90D31928-F48D-3E37-874F-220A51FD9E37> /usr/lib/libobjc.A.dylib 0x7fff9493a000 - 0x7fff9494fff7 libdispatch.dylib (228.23) <D26996BF-FC57-39EB-8829-F63585561E09> /usr/lib/system/libdispatch.dylib 0x7fff95c25000 - 0x7fff95d22ff7 libxml2.2.dylib (22.3) <47B09CB2-C636-3024-8B55-6040F7829B4C> /usr/lib/libxml2.2.dylib 0x7fff96350000 - 0x7fff96351ff7 libSystem.B.dylib (169.3) <9089D72D-E714-31E1-80C8-698A8E8B05AD> /usr/lib/libSystem.B.dylib 0x7fff96397000 - 0x7fff9639cfff libcache.dylib (57) <65187C6E-3FBF-3EB8-A1AA-389445E2984D> /usr/lib/system/libcache.dylib 0x7fff96646000 - 0x7fff9664dfff libcopyfile.dylib (89) <876573D0-E907-3566-A108-577EAD1B6182> /usr/lib/system/libcopyfile.dylib 0x7fff966bd000 - 0x7fff966c0ff7 libdyld.dylib (210.2.3) <F59367C9-C110-382B-A695-9035A6DD387E> /usr/lib/system/libdyld.dylib 0x7fff96961000 - 0x7fff96963ff7 libunc.dylib (25) <92805328-CD36-34FF-9436-571AB0485072> /usr/lib/system/libunc.dylib 0x7fff974ba000 - 0x7fff974f0fff libsystem_info.dylib (406.17) <4FFCA242-7F04-365F-87A6-D4EFB89503C1> /usr/lib/system/libsystem_info.dylib 0x7fff97850000 - 0x7fff97888fff libncurses.5.4.dylib (37.3) <68D5B5F5-8252-3F1E-AFF1-C6AFE145DBC1> /usr/lib/libncurses.5.4.dylib 0x7fff978d3000 - 0x7fff97abdff7 com.apple.CoreFoundation (6.8 - 744.18) <A60C3C9B-3764-3291-844C-C487ACF77C2C> /System/Library/Frameworks/CoreFoundation.framework/Versions/A/CoreFoundation External Modification Summary: Calls made by other processes targeting this process: task_for_pid: 0 thread_create: 0 thread_set_state: 0 Calls made by this process: task_for_pid: 0 thread_create: 0 thread_set_state: 0 Calls made by all processes on this machine: task_for_pid: 18730 thread_create: 2 thread_set_state: 0 VM Region Summary: ReadOnly portion of Libraries: Total=109.5M resident=53.3M(49%) swapped_out_or_unallocated=56.2M(51%) Writable regions: Total=20.6M written=2644K(13%) resident=3256K(15%) swapped_out=0K(0%) unallocated=17.5M(85%) REGION TYPE VIRTUAL =========== ======= MALLOC 11.8M MALLOC guard page 32K STACK GUARD 56.0M Stack 8192K __DATA 2356K __LINKEDIT 68.3M __TEXT 41.2M __UNICODE 544K shared memory 12K =========== ======= TOTAL 188.2M Model: MacBookPro8,2, BootROM MBP81.0047.B27, 4 processors, Intel Core i7, 2 GHz, 8 GB, SMC 1.69f4 Graphics: Intel HD Graphics 3000, Intel HD Graphics 3000, Built-In, 512 MB Graphics: AMD Radeon HD 6490M, AMD Radeon HD 6490M, PCIe, 256 MB Memory Module: BANK 0/DIMM0, 4 GB, DDR3, 1333 MHz, 0x80CE, 0x4D34373142353237334348302D4348392020 Memory Module: BANK 1/DIMM0, 4 GB, DDR3, 1333 MHz, 0x80CE, 0x4D34373142353237334348302D4348392020 AirPort: spairport_wireless_card_type_airport_extreme (0x14E4, 0xD6), Broadcom BCM43xx 1.0 (5.106.98.100.16) Bluetooth: Version 4.1.3f3 11349, 2 service, 11 devices, 1 incoming serial ports Network Service: Wi-Fi, AirPort, en1 Serial ATA Device: ST9500420AS, 500.11 GB Serial ATA Device: MATSHITADVD-R UJ-898 USB Device: FaceTime HD Camera (Built-in), apple_vendor_id, 0x8509, 0xfa200000 / 3 USB Device: hub_device, 0x0424 (SMSC), 0x2513, 0xfa100000 / 2 USB Device: Apple Internal Keyboard / Trackpad, apple_vendor_id, 0x0246, 0xfa120000 / 5 USB Device: BRCM2070 Hub, 0x0a5c (Broadcom Corp.), 0x4500, 0xfa110000 / 4 USB Device: Bluetooth USB Host Controller, apple_vendor_id, 0x821a, 0xfa113000 / 8 USB Device: hub_device, 0x0424 (SMSC), 0x2513, 0xfd100000 / 2 USB Device: IR Receiver, apple_vendor_id, 0x8242, 0xfd110000 / 3 

Irgendwelche Probleme mit der Verknüpfung meiner Pythons? Wie kann ich das beheben? Vielen Dank!

4 Solutions collect form web for “Homebrew + Python auf mac os x 10.8: Fatal Python error: PyThreadState_Get: kein aktueller Thread importiert mapnik”

Es sieht so aus, als ob du die Homebrew-Pythonschlange betreibst, aber entweder die Python- oder Mapnik-Pythonbindungen steigern, die mit dem System python verbunden sind, das von Apfel zur Verfügung gestellt wird. Wenn eine vollständige Reinigung und Neuinstallation von Boost und Mapnik nicht beheben dies dann empfehle ich zu stoppen von #mapnik irc auf freenode für Hilfe Debugging. In der Regel müssen Sie reparieren, müssen Sie otool -L auf boost_python.dylib und oder auf 'site_packages / mapnik / _mapnik.so' anrufen, um zu sehen, was mit einer Verknüpfung zum System python endete. Dann können Sie mit install_name_tool reparieren.

Ich habe das gleiche Problem zwischen python27-apple und python27 (installiert von Macport). Ich habe diese Schritte ausprobiert, und es hat für mich gearbeitet.

Nach den Kommentaren von @ Evert von verschiedenen Bibliotheken, die von verschiedenen Pythonen benutzt wurden, habe ich versucht, den Python27-Apfel als "aktiv" zurückzukehren.

 sudo port select --list python 

Für meinen Computer zeigte es:

 Available versions for python: none python25-apple python26 python26-apple python27 (active) python27-apple 

In dem python27 (von Macport) zurzeit aktiv war. Dann,

 sudo port select python python27-apple 

Python27-apple aktiv als die standard-lib wurden zuvor genannt. Um zu überprüfen,

 sudo port select --list python 

Es zeigte sich jetzt:

 Available versions for python: none python25-apple python26 python26-apple python27 python27-apple (active) 

Und der Python-Crash war gegangen, als ich die Skripte lief.

Ich habe das ähnliche Problem bei der Verwendung von Androguard. Obwohl es nicht ganz das gleiche ist, kann es eine Referenz sein. Mein Absturz ist auch "Fatal Python error: PyThreadState_Get: kein aktueller Thread Abort trap: 6". Führen Sie "otool -L" aus, schlagen Sie den Dylib-Link zum System python vor. Versuchen Lösung:

  1. Python-config –ldflags
  2. Kopiere die Ausgabe an die entsprechende MakeFile. Zum Beispiel: LDFLAGS + = -lm -lbz2 -lz -llzma -lnappy -lmuparser -lpython zu LDFLAGS + = -lm -lbz2 -lz -llzma -lnappy -lmuparser -L / usr / local / Keller / python / 2.7.10_2 /Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/config -lpython2.7 -ldl -Framework CoreFoundation

  3. Sauber machen, dann wieder machen

Jetzt ist das Dylib ok und kein Fehler mehr

oder

Wenn du otool benutzt – findest du den falschen Link Python Dylib. Sie können install_name_tool verwenden, um das Symbol zu markieren. mögen:

  install_name_tool -change /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Python /usr/local/Cellar/python/2.7.6_1/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/libpython2.7.dylib <lib> 

Sie können die Homebrew-Python so verwenden:

 /usr/bin/python2.7 yourscript.py 
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